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R n'aime pas les boucles: c'est long, parfois ca surtout c'est long:). Une des fonctions qu'il faut absolument maîtriser est apply. Elle permet de réaliser en parallèle la même opération sur toutes les lignes/ toutes les colonnes d'une matrice ou d 'un jeu de données. Pour utiliser apply, il faut créer une fonction qui prend en paramètre un vecteur et qui nous ressort une transformation de ce vecteur. que ce vecteur soit de la forme qu'une ligne ou qu'une colonne de notre jeu de données (prendre en compte les variables quali, l'ordre des variables.. ) lancer apply sur son jeu de données, en précisant la fonction et s'il faut le prendre en ligne ou en colonne. Lapply sous réserve. data(iris) # on va fabriquer une fonction qui, pour chaque ligne, nous donnera la somme de,, et masomme<-function(monvec){ # les vecteurs sont ici de la forme c(5. 1, 3. 5, 1. 4, 0. 2, setosa). Un simple sum(monec) ne fonctionnerait pas à cause de setosa return(sum(meric(monvec[1:4])))# le meric permet de passer outre la transformation en caractères} lasomme<-apply((iris), FUN=masomme, MARGIN=1) head(cbind(iris, lasomme))# on rajoute une colonne avec le résultat et on regarde le début du jeu de données Cette transformation restera très rapide même avec un très grand nombre de lignes 2011-12-23
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Aymeric Inpong" Bonjour Claire, Je profite régulièrement de vos articles pour améliorer ma programmation en R (plutôt artisanale) d'analyses multivariées. J'utilise des boucles, doubles ou triples, ce qui entraîne de long calculs.
La fonction apply() est principalement utilisée pour éviter les utilisations explicites des constructions de boucle. Elle est la plus basique de toutes les collections peut être utilisée sur une matrice. Lapply sous r sistible ascension du. Cette fonction prend 3 arguments: apply(X, MARGIN, FUN)Here:-x: an array or matrix-MARGIN: take a value or range between 1 and 2 to define where to apply the function:-MARGIN=1`: the manipulation is performed on rows-MARGIN=2`: the manipulation is performed on columns-MARGIN=c(1, 2)` the manipulation is performed on rows and columns-FUN: tells which function to apply. Built functions like mean, median, sum, min, max and even user-defined functions can be applied> L'exemple le plus simple est de sommer une matrice sur toutes les colonnes. Le code apply(m1, 2, sum) va appliquer la fonction sum à la matrice 5×6 et retourner la somme de chaque colonne accessible dans le jeu de données. m1 <- matrix(C<-(1:10), nrow=5, ncol=6)m1a_m1 <- apply(m1, 2, sum)a_m1 Sortie: Best practice: Stockez les valeurs avant de l'imprimer sur la console.
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