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Autres domaines de liaison à la calmoduline La liaison des ions Ca ++ à la CaM provoque un changement conformationnel qui favorise la liaison à d'autres protéines cibles, qui ne contiennent pas de motifs facilement identifiables ( cf. tableau dans Calmodulation meta-analysis: Predicting calmodulin binding via canonical motif clustering 2016). Un modèle structurel particulier (CMBD) est décrit dans les canaux potassiques sensibles au calcium (KCa), comme IK (K Ca 3) ou SK (K Ca 2). Résidus hydrophobes 1. Correspondance de motif alternative avec liaison de variable? - scala. La présence de résidus hydrophobes volumineux (F, I, L, V et W), à la première et dernière position de ces motifs, appelés aussi " ancres ", est indispensable pour ancrer la protéine aux deux lobes de la CaM. ( Calcium-induced exposure of a hydrophobic surface on calmodulin 1980). Motifs de liaisons à la calmoduline Figure: d'après Kumar) Les positions de ces résidus donne un nom à ces motifs: 1-10: [FILVW]xxxxxxxx[FILVW]; 1-5-10: [FILVW]xxx[FAILVW]xxxx[FILVW]… 2. Les résidus intermédiaires restants entre ces résidus hydrophobes sont très variables par leur séquence et leur espacement car l'hélice centrale de la CaM est très flexible, ce qui lui permet de se lier à des cibles protéiques extrêmement variées ( Backbone Dynamics of Calmodulin Studied by 15N Relaxation Using Inverse Detected Two-Dimensional NMR Spectroscopy: The Central Helix Is Flexible 1992).
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Notez ceci: Le constructeur __construct est déclaré en tant que méthode "protected" afin d'éviter la création d'une nouvelle instance en utilisant l'opérateur new. La méthode magique __clone est déclarée privée afin d'éviter le clonage d'une instance de cette classe via l'opérateur clone. La méthode magique __wakeup est déclarée privée afin d'éviter la désérialisation d'une instance de cette classe via la fonction globale unserialize(). Une nouvelle instance est créée via liaison dynamique dans la méthode de création statique getInstance() via le mot-clé static. Cela permet d'hériter de la classe Singleton dans l'exemple. Jouer à Patterns Link - Jeuxclic.com. Le motif Singleton est utile quand on a besoin de s'assurer que seule une instance de classe est requise pour l'ensemble du cycle de vie d'une application web. Cela arrive typiquement lorsque l'on a des objets globaux (tel qu'une classe de configuration par ex. ) ou une ressource partagée (comme un fil d'évènement). Vous devriez faire attention lorsque vous utilisez le motif Singleton étant donné qu'il induit un état global à votre application réduisant ainsi sa testabilité.
La séquence consensus est [FILV]Qxxx[RK]Gxxx[RK]xx[FILVWY] dans laquelle les acides aminés aux positions 1, 2, 5, 6, 11 et 14 sont hautement conservés ( A model of Ca2+-free calmodulin binding to unconventional myosins reveals how calmodulin acts as a regulatory switch 1996). Ce domaine forme une hélice α amphiphile à sept spires. Plusieurs motifs IQ sont souvent présents dans les molécules, séparés par un nombre constant de résidus, i. Liaison de motifs patterns of action. e. les liens pourraient avoir d'autres fonctions que la simple connexion des différents motifs. Protéines à domaine IQ Motifs de liaisons à la calmoduline dans Na v 1. 5 Figure: d'après Mruc) Les motifs IQ sont présents dans de nombreuses molécules qui se lient à la calmoduline, et permet aux ions Ca ++ de produire et moduler un grand nombre des processus cellulaire. On trouve ce motif dans ( cf. tableau): les myosines, les canaux voltage-dépendants, les protéines de croissance neuronales, les phosphatases, les protéines de surface du sperme, les protéines échangeuses Ras, les protéines associées au fuseau, une protéine RasGAP, plusieurs protéines spécifiques aux plantes.
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