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Alors que nous connaissons le rôle clé des microorganismes symbiotiques dans la nutrition et la protection des plantes, l'impact de l'intensification agricole sur ces microorganismes n'est cependant pas entièrement compris. L'agriculture biologique et les bordures de champs - en tant qu'éléments semi-naturels - peuvent néanmoins favoriser une plus grande diversité microbienne grâce à une moindre perturbation anthropique et une plus grande diversité végétale. Les auteurs ont échantillonné des individus de blé dans des paires de champs de blé (un biologique et un conventionnel) le long d'un gradient de distance aux bordures (haie vs. herbe), dans 20 fenêtres de paysage sélectionnées le long d'un gradient non corrélé d'agriculture biologique et de densité de haies. Ils ont démontré que l'agriculture biologique façonnait la composition microbienne et augmentait la richesse fongique et bactérienne, tandis que les haies avaient un effet neutre ou négatif sur la richesse selon les phyla (i. Maison du champ de mars rennes 1. e. séries généalogiques) microbiens considérés.
Contrairement aux bactéries, il s'est avéré que les communautés fongiques étaient distribuées de manière hétérogène dans les champs, avec une diversité plus élevée pour certains phyla près des bords des champs. Dans l'ensemble, les chercheurs ont mis en évidence que les champignons réagissaient davantage à l'échelle du champ, tandis que les bactéries étaient plus affectées par l'échelle du paysage. Il apparait donc que l'effet de l'intensification de l'agriculture sur le microbiote des plantes - et donc sur les fonctions fournies par les microorganismes aux plantes - doit être considéré à plusieurs échelles spatiales. Figure 1. Schématisation de la conception expérimentale pour évaluer l'impact du paysage sur le microbiote du blé. (A) Localisation géographique des fenêtres paysagères sélectionnées. Les ellipsoïdes noirs représentent les zones tampons de 500 m de rayon (c'est-à-dire les fenêtres paysagères) dans le site LTSER "Zone Atelier Armorique" de l'OSUR (CNRS InEE). Radio Rennes, 100.8 FM - Idées Sorties. Les points orange et verts correspondent respectivement aux centroïdes des champs conventionnels et biologiques.
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