Lapply Sous R | Mug Personnalisé Nounou - Lescréasdetiti
Modérateur: Groupe des modérateurs matthieu faron Messages: 586 Enregistré le: 16 Fév 2011, 11:23 Titre d'un graphique appelé par fonction et lapply Bonjour, J'utilise R 2. 12. 1 sous Windows XP. J'ai crée une fonction qui effectue une analyse de survie. Celle-ci doit afficher les courbes de survie à l'aide de la fonction survplot (du package rms) si p est inférieur à 0. 05. Je souhaiterais afficher comme titre de la courbe le nom de cette variable. J'ai réussi à trouvé sur le forum et dans les aides sur internet: Code: Tout sélectionner titre <- paste("Overall Survival:", substitute(var)) print(titre) text(titre[3], xpd=T, x=12, y=1. Lapply sous romilly. 1, font=2) ou var est le nom de la variable testé et l'argument de la fonction. Quand j'appelle la fonction directement çà marche mais quand j'appelle la fonction par lapply (pour la faire sur toutes les variables que je veux du data-frame) impossible de réussir à afficher le nom de cette variable. J'ai essayé avec: Mais ceci superpose 1 ligne pour tous les éléments du vecteur var... et pas son nom.
Lapply Sous Romilly
936 ## iris$Species: virginica ## [1] 6. 588 On peut aussi employer cette syntaxe: with(iris, tapply(, Species, mean)) ## 5. 588 Et comme précédemment, si la fonction employée nécessite des arguments supplémentaires, on les ajoute après la virgule: res <- with(iris, tapply(, Species, quantile, probs=c(0. 75))) ## $setosa ## 4. 8 5. 2 ## $versicolor ## 5. Lapply sous r la publication. 6 6. 3 ## $virginica ## 6. 225 6. 900 ## [1] "array" La fonction apply permet d'appliquer une fonction sur toutes les lignes ou toutes les colonnes d'un data frame (ou une matrice). Si on souhaite appliquer la fonction sur les lignes, on va spécifier l'argument MARGIN=1 (en pratique, on utilise que le 1 en second argument de la fonction). De la même manière, si on souhaite appliquer la fonction sur les colonnes, on va spécifier l'argument MARGIN=2 (là encore, en pratique, on utilise que le 2 en second argument de la fonction) Par exemple ici, si on souhaite faire la moyenne des 4 premières variables du jeu de données iris, sur les 10 premières lignes: res <- apply(iris[1:10, 1:4], 1, mean, ) ## 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ## 2.
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Ce tutoriel a pour but de présenter la collection de fonctions apply(). La fonction apply() est la plus basique de toutes les collections. Nous apprendrons également sapply(), lapply() et tapply(). La collection apply peut être considérée comme un substitut de la boucle. La collection apply() est regroupée avec le paquet r essential si vous installez R avec Anaconda. La fonction apply() peut être alimentée avec de nombreuses fonctions pour effectuer une application redondante sur une collection d'objet (cadre de données, liste, vecteur, etc. ). Le but de apply() est principalement d'éviter l'utilisation explicite de constructions en boucle. Comment appliquer une fonction à une liste ? : lapply ; sapply ? - Astuces et scripts R. Elles peuvent être utilisées pour une liste, une matrice ou un tableau en entrée et appliquer une fonction. N'importe quelle fonction peut être passée dans apply(). Dans ce tutoriel, vous apprendrez la fonction apply() la fonction lapply() la fonction sapply() La fonction Slice vector. fonction tapply() fonction apply() apply() prend en entrée un cadre de données ou une matrice et donne en sortie un vecteur, liste ou tableau.
R n'aime pas les boucles: c'est long, parfois ca surtout c'est long:). Une des fonctions qu'il faut absolument maîtriser est apply. Elle permet de réaliser en parallèle la même opération sur toutes les lignes/ toutes les colonnes d'une matrice ou d 'un jeu de données. Pour utiliser apply, il faut créer une fonction qui prend en paramètre un vecteur et qui nous ressort une transformation de ce vecteur. que ce vecteur soit de la forme qu'une ligne ou qu'une colonne de notre jeu de données (prendre en compte les variables quali, l'ordre des variables.. ) lancer apply sur son jeu de données, en précisant la fonction et s'il faut le prendre en ligne ou en colonne. data(iris) # on va fabriquer une fonction qui, pour chaque ligne, nous donnera la somme de,, et masomme<-function(monvec){ # les vecteurs sont ici de la forme c(5. 1, 3. 5, 1. 4, 0. Chapitre 8 Les fonctions apply | Apprendre à programmer avec R. 2, setosa). Un simple sum(monec) ne fonctionnerait pas à cause de setosa return(sum(meric(monvec[1:4])))# le meric permet de passer outre la transformation en caractères} lasomme<-apply((iris), FUN=masomme, MARGIN=1) head(cbind(iris, lasomme))# on rajoute une colonne avec le résultat et on regarde le début du jeu de données Cette transformation restera très rapide même avec un très grand nombre de lignes 2011-12-23
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